Filogènia

 
   
 
Desprès de fer una comparació multiple amb ClustalW amb les seqüències de la DNA polimerases de diferents herpesvirus podem diferenciar subfamílies víriques dins d'aquest grup.

Les seqüències que es van usar es troben a la pestanya d'analisi de dades.

Ja realitzat l'alineament de les diferentes seqüències de la DNA polimeras, observem els resultats

Resultats del ClustalW

La DNA polimerasa d'herpesvirus exhibeix el major nivell de conservació amb els membres de la familia herpesviridae i demostra que cal subdividir en subfamilies Alpha- Beta- i gammaherpesvirinae.

Arbre realitzat amb el treeview a partir de l'aliniament múltiple pel clustalW

 

Aquest arbre desarrelat va ser realitzat amb el programa treeview a partir del fitxer Guide tree file

obtingut en l'aliniament múltiple amb el programa ClustalW.

 

Arbre que van realitzar en l'article en que he basat el treball

A l'anàlisi es mostra que els gens de la polimerasa tant en ILTV com en PsHV-1 tenen gran similitut amb la subfamilia alphaherpesvirinae i són clarament diferenciats dels mardivirus (MDV-1 i 2) i del vulture herpesvirus (VHV). D'aquesta manera els dos virus de la comparació defineixen un nou clado.