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Curso programación en Python avanzado para bioinformáticos 

Objetivos

Python es un lenguaje de programación cada vez más popular entre los bioinformáticos ya que es versátil, es útil para tratar secuencias y es sencillo de aprender. Python combina una potencia remarcable con una sintaxi clara y limpia. Python tiene múltiples aplicaciones en el campo de la bioinformática, permitie varios paradigmas de programación y es muy utilizado como lenguaje para crear scripts,  por estos motivos, resulta clave en la resolución de problemas computacionales en campos muy diversos de la bioinformática.

Estructura del curso:

El curso ofrecido intercala teoría y prácticas con ejercicios tutorizados con distintos niveles de complejidad hasta realizar un ejercicio final integrador en el que se deben aplicar los conocimientos adquiridos durante el curso.

A quién va dirigido:

El curso está dirigido a estudiantes o profesionales de la investigación con interés o necesidades de profundizar en el mundo de la programación para su aplicación en el campo de la bioinformática.

Requisitos previos:

Este curso requiere conocimientos previos de programación. El alumno debe tener conocimientos de programación en algún otro lenguaje, no son necesarios conocimientos básicos de Python, ya que el curso empezará explicando toda la sintaxi básica de Python pero no profundizará en aspectos generales como tipos de datos o control de flujo.

Contenidos

  • Python básico
    • El entorno Python: instalación y uso de Python
    • Los elementos de Python: tipos de datos
    • Profundizando en Python: funciones, módulos, paquetes y programación orientada a objetos
  • Big Data
    • numpy
    • pandas
  • Estadística
    • RPy: R desde Python
    • statsmodels: estadística directa desde Python
    • matplotlib: creación de gráficas con Python
    • E.T.E.: creación de árboles filogenéticos
  • Ejercicio integrador

  • Resolución de problemas específicos de cada asistente

 

Profesorado:

Carles Hernandez

Información práctica:

El curso tendrá lugar -- fechas por determinar -- en la Universitat Autònoma de Barcelona.

El curso se ofrece en castellano, catalán e inglés. Indica en observaciones el idioma de preferencia.

Cada alumno dispondrá de un ordenador personal para el seguimiento del curso.

Coste:

300€

Los siguientes colectivos tienen un 20% de descuento.

  • Estudiantes universitarios
  • Personal docente e investigador de la UAB
  • Personal de centros adscritos a la UAB
  • Personal de la esfera UAB-CEI.

Los que se inscriban en 2 o más cursos tienen un 10% de descuento en el precio final.

Número de alumnos:

Dada la atención personalizada que se pretende ofrecer en el curso hay un máximo de 12 plazas.

En caso de que no se llegue a un mínimo de 5 asistentes el curso no se realizará.

Inscripciones:

Plazo de inscripción no abierto, para más información rellena el siguiente formulario.


 

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Cursos de Bioinformática de la Unidad de Bioinformática del Servei de Genòmica i Bionformàtica de la UAB

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Contacto

Servei de Genòmica i Bioinformàtica

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(Mòdul B) - Campus UAB
08193 Cerdanyola del Vallès
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sgb.bioinformatica@uab.cat

Tel.+34 93 586 8942


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