imprimir | pdf             intranet                                                                                                            

Otros talleres: Navegadores genóm.

Perl básico  BioPerl  Perl avanzado  Perl y Bases de datos  Perl y web  Bases de datos  Navegadores genóm.  Python avanzado  
            

Taller de navegadores genómicos

Objetivos:

El almacenamiento de la información de forma eficiente hoy en día, puede llegar a ser un reto debido a la gran cantidad de datos que se generan. Las bases de datos permiten almacenar la información de forma ordenada y estructurada para facilitar su gestión, manipulación y consulta. MySQL es un sistema gestor de bases de datos de libre distribución ampliamente utilizado.

El lenguaje SQL permite la gestión tanto de la estructura como del contenido de una base de datos y ofrece mucha más flexibilidad y potencia que los programas de gestión de bases de datos.

Estructura del taller:

El taller ofrecido intercala teoría y prácticas con ejercicios tutorizado con distintos niveles de complejidad hasta realizar un ejercicio final integrador en el que se deben aplicar los conocimientos adquiridos durante el taller.

A quién va dirigido:

El taller está dirigido a estudiantes o profesionales de la investigación con interés o necesidades de conocer, crear y/o gestionar un navegador genómico para la representación de los datos.

Requisitos previos:

Este taller no requiere conocimientos previos de programación.

Contenidos:

  • Introducción a las bases de datos genómicas

  • Sistemas de coordenadas

  • Formatos de ficheros:

    • BED

    • GFF

    • VCF

    • WIG

    • SAM/BAM

  • Navegadores genómicos

    • NCBI MapViewer

    • UCSC GenomeBrowser

    • ENSEMBL GenomeBrowser

    • Vista Browser

    • IGV

    • GenomeMaps

    • GBrowse

  • Ejercicio integrador: crea y configura un navegador genómico

  • Resolución de problemas específicos de cada asistente

Profesorado:

Dr. Miquel Ràmia, Dra. Raquel Egea

Información práctica:

El taller tendrá lugar --por determinar-- en la Universitat Autònoma de Barcelona.

El taller se ofrece en castellano, catalán e inglés. Indica en observaciones el idioma de preferencia.

Cada alumno dispondrá de un ordenador personal para el seguimiento del curso.

Coste:

150€

Los siguientes colectivos tienen un 20% de descuento.

  • Estudiantes universitarios
  • Personal docente e investigador de la UAB
  • Personal de centros adscritos a la UAB
  • Personal de la esfera UAB-CEI.

Los que se inscriban en 2 o más talleres tienen un 10% de descuento en el precio final.

Número de alumnos:

Dada la atención personalizada que se pretende ofrecer en el taller hay un máximo de 24 plazas.

En caso de que no se llegue a un mínimo de 10 asistentes el taller no se realizará.

Inscripciones:

Para inscribirse en el taller, rellena el siguiente formulario. 


 

Talleres | Otros talleres | Profesorado | Tarifas | Inscríbete | Links de interés | Contacto | 





Talleres de Bioinformática de la Unidad de Bioinformática del Servei de Genòmica i Bionformàtica de la UAB

Contacto

Servei de Genòmica i Bioinformàtica

IBB-Parc de Recerca UAB
(Mòdul B) - Campus UAB
08193 Cerdanyola del Vallès
Barcelona

sgb.bioinformatica@uab.cat

Tel.+34 93 586 8942


Enjoy the Power of Bioinformatics Thinking!