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Curso de Navegadores genómicos 

Objetivos

Los navegadores genómicos son interfaces gráficas que muestran la información de datos biológicos, especialmente de datos genómicos. Los navegadores genómicos permiten a los investigadores visualizar y navegar a través de los genomas, facilitando de este modo la visualización de datos tales como la predicción y estructura de genes y proteínas, la expresión génica, secuencias de regulación, variación nucleotídica,...

Hoy en día, no sólo existen multitud de sitios web con navegadores genómicos, sino que también se han definido unos estándares para la creación y gestión de navegadores genómicos locales.

Estructura del curso:

El curso ofrecido intercala teoría y prácticas con ejercicios tutorizado con distintos niveles de complejidad hasta realizar un ejercicio final integrador en el que se deben aplicar los conocimientos adquiridos durante el curso.

A quién va dirigido:

El curso está dirigido a estudiantes o profesionales de la investigación con interés o necesidades de conocer, crear y/o gestionar un navegador genómico para la representación de los datos

Requisitos previos:

Este curso no requiere conocimientos previos de programación

Contenidos

  • Introducción a las bases de datos genómicas
  • Sistemas de coordenadas
  • Formatos de ficheros:
    • BED
    • GFF
    • VCF
    • WIG
    • SAM/BAM
  • Navegadores genómicos
    • NCBI MapViewer
    • UCSC GenomeBrowser
    • ENSEMBL GenomeBrowser
    • Vista Browser
    • IGV
    • GenomeMaps
    • GBrowse
  • Ejercicio integrador: crea y configura un navegador genómico
  • Resolución de problemas específicos de cada asistente

 

Profesorado:

Miquel Ramia

Información práctica:

El curso tendrá lugar -- fechas por determinar -- en la Universitat Autònoma de Barcelona.

El curso se ofrece en castellano, catalán e inglés. Indica en observaciones el idioma de preferencia.

Cada alumno dispondrá de un ordenador personal para el seguimiento del curso.

Coste:

175€

Los siguientes colectivos tienen un 20% de descuento.

  • Estudiantes universitarios
  • Personal docente e investigador de la UAB
  • Personal de centros adscritos a la UAB
  • Personal de la esfera UAB-CEI.

Los que se inscriban en 2 o más cursos tienen un 10% de descuento en el precio final.

Número de alumnos:

Dada la atención personalizada que se pretende ofrecer en el curso hay un máximo de 12 plazas.

En caso de que no se llegue a un mínimo de 5 asistentes el curso no se realizará.

Inscripciones:

Plazo de inscripción no abierto, para más información rellena el siguiente formulario.


 

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Contacto

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Tel.+34 93 586 8942


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